在对来访者的灵性状态进行了详细评估之后，如治疗师觉得有必要且来访者同意，就可以开始进行灵性干预。如果灵性方面的话题只是涉及意义层面的讨论，那么存在-人本主义一类的疗法常常是可行的。但目前的灵性干预早已超出了这一范畴，而包括了宗教的教义学习、宗教实践和仪式的运用以及其他方法。
    在一个面向咨询专业学生的实验教学课中，Glass讲授了四种灵性干预方法：聚焦（focusing），祈祷轮(prayer wheel)，宽恕(forgiveness)，以及冥想(meditation)。
    例如，宽恕是一个包含四个步骤的干预方法：
一、揭露：鼓励来访者探索过去由他人导致的伤痛，或自己的悔恨，以找出需要宽恕的人或事件。问诸如“告诉我你对什么最感到不满”、“告诉我你最大的悔恨”等问题。
二、决定：来访者评价保留这些伤痛或悔恨的结果。
三、工作：与来访者谈论在考虑宽恕时内心涌出来的想法、情感或表象。
四、结果：咨询师和来访者共同创立某种仪式来表示这一宽恕过程的结束。
这时重要的是咨询师须提醒来访者宽恕是一个过程且需要时间，但让来访者通过一个仪式来表明他们想要宽恕和“让它走吧”的愿望也是有帮助的（如写一封信然后烧了它或形象化地表演宽恕某人或自己）。根据教学设计，以上干预方法属于不冒犯特定信仰的干预技术，因而适用于各种信仰的来访者。
    Eck列举了39种可用于对犹太-基督教来访者进行临床干预的宗教修炼或实践，将它们分成三类：认知定向、行为定向和人际关系定向的。认知定向的修炼有冥想、倾听、经文学习（scripture)、祈祷等等，可用于帮助改善常见于抑郁或焦虑症状的破坏性的内心对话、“极度负面或夸张的自我评估，或任何破坏性的思维模式”。
    行为定向的修炼主要针对不良行为模式和日常生活方式，分为三类：（1）俭朴（simplicity）、节俭、禁食、贞洁等主要针对行为失控和过度（如物质主义（materialism）、暴食、滥交）；（2）慢下来（slowing）、安息日、独处（solitude）等帮助那些有强迫性活动或追逐金钱权力的来访者寻找平衡、发现生活意义以及关注自我，在一个案例中，婚姻咨询师向一对犹太教来访者夫妇布置了“安息日”家庭作业，要求他们抽出一天时间，停下所有工作与家务，专门用于两人相处，这一活动增进了他们的交流，并加强了他们婚姻的灵性基础（Chase,1997）；（3）服务、牺牲和受苦等主要帮助那些过分自我关注以及看不见奋斗和成长之间联系的来访者自我成长、提高生产性和在自身之外寻找生活意义。
    除此之外，还有忏悔、宽恕、崇拜、团契、见证、祈求等关系定向的修炼。
    以上干预方法的选用既要考虑来访者的问题特点，也要考虑治疗模式，例如，进行认知干预的治疗师可以结合使用认知定向的修炼，而进行行为干预的治疗师则可以结合行为定向的修炼。虽然这些是针对犹太-基督教来访者的干预方法，但非犹太-基督教信仰的治疗师也可使用它们（当面对犹太-基督教来访者时），前提条件是治疗师需了解自己的价值、信念、冲突、偏见等是否会妨碍这些干预方法的使用（此原则对犹太-基督教信仰的治疗师也适用，因为当治疗师与来访者具有相同信仰且治疗师对灵性感兴趣时，治疗师有可能会偏离帮助来访者解决问题的目标，而不自觉地扮演起灵性指导者的角色，即试图使来访者在信仰上更加虔诚。 　　
     Wendel举了一个例子来说明恰当的灵性干预是如何进行的。
    一对信仰基督教原教旨主义的夫妇正面临婚姻冲突，因为丈夫坚持要对一切问题具有最后的决定权。他之所以这样做，是由于《圣经》上说男人是家里的头。妻子抱怨他不听她和孩子们的意见，这场冲突把两个孩子也卷了进来。当他们前来进行家庭治疗时，治疗师首先会从临床的角度观察问题，他/她会考虑家庭和婚姻幸福的理论、三方的沟通和冲突以及性别问题等等，然后转换到宗教角度，考虑《圣经》上不同章节的叙述、《圣经》注释理论、信仰发展理论、上帝形象以及更细节化的问题如关于家庭生活的神学理论等；他/她也会评估这一家庭在临床和宗教方面的需求。在治疗过程中，治疗师不时地在临床和宗教领域之间转换，以便找到同时符合两方面需求的干预，然后付诸实行。如果找不到这样的干预，治疗师会指出在家庭内存在着目标上的冲突。这样的处理保证了来访者在临床和灵性方面的需求同等地受到尊重